刺薊散中加入升麻，主要是因為升麻具有以下兩點功效，與方劑整體治療目的相符：
疏散風熱，清熱解毒：刺薊散主治風熱上攻，引起咽喉腫痛、口舌生瘡等症。升麻性涼，善於疏散風熱，並能清熱解毒，可幫助清除咽喉部位的熱毒，達到消炎止痛的效果。
升陽舉陷：升麻具有升陽舉陷之效，可提振機體陽氣，使之升浮，有助於改善因風熱上攻所致的氣虛下陷症狀，例如頭昏乏力、倦怠嗜睡等。
因此，刺薊散中加入升麻，不僅可以清熱解毒，緩解咽喉腫痛等症狀，更能提升機體抵抗力，達到整體治療效果。
刺薊散中加入鹿角膠，主要基於以下兩個原因：
補腎壯陽，益精填髓： 鹿角膠性溫，味甘鹹，入肝、腎經，具有補腎壯陽，益精填髓之效。刺薊散主治肝腎不足，血虛氣弱所致的各種出血症，而鹿角膠的補腎益精作用，能為治療提供必要的精血滋養，提升療效。
止血生肌，固澀止瀉： 鹿角膠還有止血生肌，固澀止瀉的功效。刺薊散中常配伍其他止血藥物，鹿角膠的加入可以加強止血效果，同時也能促進創傷癒合。對於伴隨出血症出現的腸胃不適，鹿角膠也有助於緩解症狀。
刺薊散中加入羚羊角，是基於其清熱解毒、鎮驚熄風的功效。
羚羊角味苦、鹹，性寒，入心、肝經。其清熱解毒之功，能有效清除體內熱毒，緩解刺薊散治療的瘡瘍腫毒、毒蛇咬傷等症狀。同時，其鎮驚熄風之效，可鎮定神志，緩解因熱毒入腦引起的煩躁、驚厥等症狀，使治療更加全面有效。
刺薊散中加入竹茹，主要基於其清熱止嘔之功效。
竹茹性寒，味甘，入肺經，具有清熱化痰、止嘔降逆的功效。刺薊散乃針對肝膽濕熱所致的黃疸、腹痛、嘔吐等症，而竹茹可清熱解毒，化解肝膽濕熱，並能降逆止嘔，緩解因肝膽濕熱上擾所引起的嘔吐症狀。
此外，竹茹還能清熱止咳，對於伴有咳嗽的患者，也能起到輔助治療的作用。
刺薊散方劑中加入當歸，主要基於以下兩點原因：
補血活血，緩解刺痛感：當歸性溫，味甘辛，入心、肝、脾經。具有補血活血、調經止痛的功效。刺薊散主要用於治療肝膽濕熱所致的脅肋刺痛、口苦咽乾、小便赤澀等症狀，而當歸的補血活血作用可以緩解肝膽濕熱引起的疼痛，並改善因氣血不足而導致的刺痛感。
養血柔肝，改善肝功能：刺薊散中的其他藥物如刺蒺藜、茵陳等，都具有清熱利濕、解毒消腫的作用。而當歸則能養血柔肝，起到保護肝臟、促進肝功能恢復的作用，與其他藥物配合使用，可有效改善肝膽濕熱引起的肝功能損害。
刺薊散中包含生地黃，主要是因為生地黃具有清熱涼血、滋陰潤燥的功效，可以協同其他藥材，達到以下目的：
清熱解毒： 刺薊散主治熱毒壅盛所致的瘡瘍腫毒，而生地黃的清熱涼血作用可以有效清除體內的熱毒，降低炎症反應。
滋陰潤燥： 瘡瘍腫毒的形成常伴隨津液不足，導致局部組織乾燥，生地黃的滋陰潤燥作用可以補充津液，促進傷口癒合。
因此，生地黃在刺薊散中起到清熱涼血、滋陰潤燥的輔助作用，與其他藥材相輔相成，共同發揮治療功效。
刺薊散中加入甘草，主要有以下兩個原因：
一、調和藥性： 刺薊散中多用辛涼、苦寒藥物，如刺薊、茵陳等，容易傷脾胃。甘草性甘平，入脾胃經，具有緩和藥性、調和脾胃的作用，能保護脾胃不受寒涼藥物侵襲，避免藥物毒性。
二、增強療效： 甘草味甘，能增強藥物療效。刺薊散主治肝膽濕熱，甘草能引藥入肝膽，增強其他藥物清熱利濕的作用，同時甘草還能緩解刺薊等藥物苦寒之性，使藥效更溫和，不易傷脾胃。